Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZCCHC17Q9NP64 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms