Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms