Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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