Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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