Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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