Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTLL5Q6EMB2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms