Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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