Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CUL3Q13618 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CUL3Q13618 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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