Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms