Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCC8Q09428 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms