Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX3P78415 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX3P78415 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 732.1 ms