Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNB3P54284 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms