Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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