Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms