Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms