Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms