Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTGFP29279 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTGFP29279 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms