Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD1P28340 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms