Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms