Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GLI3P10071 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms