Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DENRO43583 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DENRO43583 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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