Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf172C9J069 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms