Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms