Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCO2Q9BYV7 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms