Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms