Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms