Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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