Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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