Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TLR1Q15399 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms