Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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