Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms