Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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