Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms