Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JAG1P78504 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JAG1P78504 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms