Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCLCP48506 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms