Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIP4K2AP48426 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms