Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms