Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCN4AP35499 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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