Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms