Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP1P29466 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP1P29466 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms