Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms