Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms