Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTSSP25774 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTSSP25774 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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