Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HRCP23327 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HRCP23327 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HRCP23327 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms