Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NTF3P20783 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NTF3P20783 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
NTF3P20783 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms