Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RLBP1P12271 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms