Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms