Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LTAP01374 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LTAP01374 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LTAP01374 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LTAP01374 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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LTAP01374 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LTAP01374 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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