Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CALCAP01258 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CALCAP01258 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CALCAP01258 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CALCAP01258 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CALCAP01258 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CALCAP01258 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CALCAP01258 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms