Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SCN2BO60939 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms